Сейчас правила ФТСР не позволяют однозначно трактовать этот вопрос. Было бы хорошо, если бы в официальном документе президиума ФТСР добавилось дополнение к пункту 3.16
Что-то типа этого:
"При рассчёте количества очков по одной из программ в классах Е, Д, С, очки набранные в двоеборье делятся пополам."